现代著名的自然疗法之父葛森医师，在以补充有机生长的新鲜蔬果为基础而发展出的排毒理论中，最推崇咖啡灌肠，他在治疗癌症病患时，提供癌症病患大量的蔬果汁，这些蔬果汁有快速排毒作用，使病人的血液里充满了大量肝脏无法及时排除的毒素，所以哥森用一天5~6次的咖啡灌肠，帮助肝脏解毒，以舒缓患者因大量毒素排到血液中所造成的昏沈感甚至头痛。哥森医师提倡的代谢疗法重点就是结肠清洁。第一先清肠排毒，第二补充完整营养，最后才能对抗疾病。
肝脏和肠道的功能不健全是一切疾病的根源。
为什么要用咖啡灌肠？
葛森疗法中推崇咖啡灌肠，葛森在治疗癌症病患时，提供癌症病患大量的蔬果汁，这些蔬果汁的排毒作用，使病人的血液里充满了大量肝脏无法及时排除的毒素，所以葛森用一天5~6次的咖啡灌肠，帮助癌症患者肝脏解毒，以舒缓患者因大量毒素排到血液中所造成的昏沉感。
1981年，华登堡医师以科学证明咖啡含有的成分，可帮助酵素分解血液中的毒素，使得有数十年传统的咖啡灌肠法的效用重新受到肯定
1996年，尼可拉斯医生以胰脏酵素搭配咖啡灌肠对胰脏癌的研究，获得美国国家研究院140万美元的资金援助。
日本新谷弘实医师以本人30多年咖啡灌肠的经验，参考研究资料，着书大力提倡咖啡灌肠给他的病人及读者。
咖啡灌肠的好处：
1.咖啡因促进谷胱甘肽酶的分泌，后者为肝脏解毒和消除自由基最重要的酵素。
2.咖啡所含的咖啡因及茶碱扩张肠壁的血管并缓和肠炎。
3.咖啡灌肠所注入的咖啡，清洁了肛门附近左侧的大肠，此处为大肠最容易藏污纳垢、宿便最多及恶菌繁殖力最强的地方。
4.口服的咖啡会刺激胃壁，其所含的杀菌成份，对于大肠上部的有益菌不利。
5.咖啡灌肠处理了肝脏每日所排出的毒素，对维护肝脏的健康有很大的助益，此解释了咖啡灌肠对癌症病患的意义。
6.灌肠液本身会刺激内脏神经系统、促进蠕动，以及将稀释的毒性胆汁从十二指肠输送到直肠。
7.由于灌肠液会停留最多15分钟，而且体内所有血液大约每3分钟就会通过肝脏一次，因此咖啡灌肠代表这一种透过肠壁进行血液透析的形式15分钟进行了5次。
葛森博士指定的配合咖啡灌肠的饮食疗法作法，也就是提供“限制钠和脂肪，提供高钾、高微量营养素的水果蔬菜、限制动物蛋白，全食物蔬”的餐饮，旨在提供所有细胞呼吸和能量生成所需的已知及未知营养素。高钾低钠的环境，倾向于使细胞巨分子回到正常构形状态，并改善水分结构及水含量。葛森博士又另外以醋酸钾、单磷酸钾和葡萄糖酸钾补充饮食中的钾盐，饮食中经常食用的苹果又能补充苹果酸盐。改善粒腺体生产能量时柠檬酸循环（又称克氏循环、三酸羧循环）的效率。克氏循环是一系列酵素反应，在这些反应中，身体利用碳水化合物，蛋白质和脂肪，产生二氧化碳、水和能量，用于器官的运作。葛森博士以限制动物性蛋白质，作为退化性疾病患者的暂时治疗措施。
这种方法早在十九世纪晚期，就被观察到有助于减少细胞水肿。施予高负荷剂量（编注：指给药时的较高的起始剂量，通常之后会因疗程的进展而调整下降为较低的“ 维持剂量” ）的甲状腺激素和鲁格尔试剂， 可以让拥有自己的D N A和R N A、可独立于细胞外自行复制的粒腺体增生。甲状腺已知能改善细胞的糖类氧化，藉此增加三磷酸腺苷的生产量，让细胞能量显著提升。
咖啡灌肠核心的理念是运用疏导：一是肝胆的解毒功能，二是人体新陈代谢能力，从而为人体排除毒素打开了通道，营造一个高免疫力、高修复力的自然健康人体。
咖啡灌肠的好处：
1、咖啡因促进谷胱甘肽酶的分泌，后者为肝脏解毒和消除自由基最重要的酵素。
2、咖啡所含的咖啡因及茶碱扩张肠壁的血管并缓和肠炎。
3、咖啡灌肠所注入的咖啡，清洁了肛门附近左侧的大肠，此处为大肠最容易藏污纳垢、宿便最多及恶菌繁殖力最强的地方。
4、口服的咖啡会刺激胃壁，其所含的杀菌成份，对于大肠上部的有益菌不利。
5、咖啡灌肠处理了肝脏每日所排出的毒素，对维护肝脏的健康有很大的助益，此解释了咖啡灌肠对癌症病患的意义。
6、灌肠液本身会刺激内脏神经系统、促进蠕动，以及将稀释的毒性胆汁从十二指肠输送到直肠。
7、由于灌肠液会停留最多15分钟，而且体内所有血液大约每3分钟就会通过肝脏一次，因此咖啡灌肠代表这一种透过肠壁进行血液透析的形式15分钟进行了5次。
8、减少血清毒素，以去除受损正常细胞（巨分子）的慢性障碍。
9、改善细胞的钾离子含量。
10、减少细胞的钠含量。
11、藉由改善水结构而减少细胞肿胀。
12、增加细胞粒腺体的数量和活性。
13、供应细胞产生能量和修复所需的微量营养素。
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